学校溯源于1906年建立的川东师范学堂，历经近百年传承演变，2005年，西南师范大学、西南农业大学合并组建为西南大学，开启了学校发展崭新篇章。
西南大学研究生教育始于20世纪50年代。1981年学校被国务院批准为首批硕士、博士授予单位，并培养了中国第一位课程与教学论博士。西南大学组建以来，研究生教育在学科建设、导师队伍和人才培养方面都得到了迅速、全面的发展，于2011年成立研究生院。
学校现有3个国家重点学科（基础心理学、特种经济动物饲养、课程与教学论）、2个国家重点（培育）学科（生态学、果树学）、39个省部（市）级重点学科、19个博士后科研流动站、28个一级学科博士学位授权点，51个一级学科硕士学位授权点，
全国第四轮学科评估总共三个A-学科。其他学科也不错，B类学科总共有20个，整体排名都很靠前的。
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